Вчена рада ФБМІ є колегіальним органом управління факультетом, якому частину своїх повноважень делегує Вчена рада КПІ ім. Ігоря Сікорського.
До повноважень Вченої ради факультету належать: визначення загальних напрямів розвитку наукової діяльності факультету; розгляд і рекомендація до затвердження планів та програм навчання, планів науково-методичних і наукових досліджень факультету, у тому числі підручників, навчальних посібників, монографій тощо; вирішення питань організації освітнього процесу та профорієнтаційної роботи на факультеті; затвердження звітів декана факультету, заступників декана факультету за напрямами їх діяльності, керівників структурних підрозділів факультету; ухвалення річного плану роботи і звіту про роботу за минулий рік факультету; розгляд і надання рекомендації Вченій раді Університету рекомендацій щодо кандидатур для присвоєння вчених звань; розгляд та затвердження звітів аспірантів факультету; розгляд та надання рекомендацій щодо кошторису витрат факультету; визнання документів про підвищення кваліфікації науково-педагогічних працівників факультету; розгляд та надання рекомендацій щодо інших актуальних питань діяльності факультету.
Склад Вченої ради ФБМІ:
| Максименко Віталій Борисович | Голова вченої ради, професор кафедри БМІ, д.мед.н., проф. |
| Галкін Олександр Юрійович | Декан ФБМІ, д.б.н., проф. |
| Беспалова Олена Ярославівна | Вчений секретар, доцент кафедри трансляційної медичної біоінженерії, к.б.н., с.н.с. |
| Білошицька Оксана Костянтинівна | Перший заступник декана, заступник декана з навчально-виховної роботи, доцент кафедри біомедичної інженерії, к.т.н., доц. |
| Мотроненко Валентина Василівна | Заступник декана з навчально-методичної, доцент кафедри трансляційної медичної біоінженерії, доктор філософії, доц. |
| Голембіовська Олена Ігорівна | Заступник декана з наукової роботи, доцент кафедри трансляційної медичної біоінженерії, к.фарм.н. |
| Калашнікова Лариса Євгеніївна | Заступник декана з міжнародного співробітництва, доцент кафедри біомедичної інженерії, к.б.н., доц. |
| Бесараб Олександр Борисович | Завідувач кафедри трансляційної медичної біоінженерії, к.т.н., доц. |
| Бойко Ганна Леонідівна | Завідувач кафедри технологій оздоровлення і спорту, к.п.н., доц. |
| Алхімова Світлана Миколаївна | В.о. завідувача кафедри біомедичної кібернетики, к.т.н., доц. |
| Худецький Ігор Юліанович | Завідувач кафедри біобезпеки і здоров’я людини, д.мед.н., проф. |
| Шликов Владислав Валентинович | Завідувач кафедри біомедичної інженерії, д.т.н., доц. |
| Гордецька Олена Костянтинівна | Доцент кафедри біомедичної кібернетики, к.т.н., доц. |
| Новицький Юрій Володимирович | Доцент кафедри технологій оздоровлення і спорту, к.п.н., доц. |
| Поєдинок Наталія Леонідівна | Доцент кафедри трансляційної медичної біоінженерії, д.б.н., с.н.с. |
| Антонова-Рафі Юлія Валеріївна | Доцент кафедри біобезпеки і здоров’я людини, к.т.н., доц. |
| Хіміч Ігор Юрійович | Секретар експертно-кваліфікаційної комісії ФБМІ, доцент кафедри технологій оздоровлення і спорту, к.п.н., доц. |
| Журавльов Сергій Олексійович | Голова профбюро ФБМІ, старший викладач кафедри технологій оздоровлення і спорту |
| Матвєєва Ілона Олегівна | Голова профбюро студентів ФБМІ, студентка гр. БМ-11ф |
| Тодоров Ярослав Сергійович | Голова студентської ради ФБМІ, староста групи БМ-02 |
| Черних Максим Андрійович | Заступник голови студентської ради ФБМІ, студент гр. ЗФ-31мп |